Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 AC244205.2-202ENST00000635781 342 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC3.77□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
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