Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC1.91□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
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HOXD1Q9GZZ0 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
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HOXD1Q9GZZ0 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
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HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
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HOXD1Q9GZZ0 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
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