Protein–RNA interactions for Protein: Q70EK8

USP53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, humanhuman

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Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53Q70EK8 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
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USP53Q70EK8 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
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USP53Q70EK8 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.89
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USP53Q70EK8 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
USP53Q70EK8 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
USP53Q70EK8 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
USP53Q70EK8 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
USP53Q70EK8 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
USP53Q70EK8 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
USP53Q70EK8 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
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USP53Q70EK8 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
USP53Q70EK8 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
USP53Q70EK8 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
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