Protein–RNA interactions for Protein: Q6SPF0

SAMD1, Atherin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD1Q6SPF0 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SAMD1Q6SPF0 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SAMD1Q6SPF0 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SAMD1Q6SPF0 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SAMD1Q6SPF0 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SAMD1Q6SPF0 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SAMD1Q6SPF0 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SAMD1Q6SPF0 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SAMD1Q6SPF0 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SAMD1Q6SPF0 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
SAMD1Q6SPF0 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
SAMD1Q6SPF0 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SAMD1Q6SPF0 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SAMD1Q6SPF0 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SAMD1Q6SPF0 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SAMD1Q6SPF0 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SAMD1Q6SPF0 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SAMD1Q6SPF0 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SAMD1Q6SPF0 AC008745.1-201ENST00000604064 271 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SAMD1Q6SPF0 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SAMD1Q6SPF0 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SAMD1Q6SPF0 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SAMD1Q6SPF0 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SAMD1Q6SPF0 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SAMD1Q6SPF0 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SAMD1Q6SPF0 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SAMD1Q6SPF0 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SAMD1Q6SPF0 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SAMD1Q6SPF0 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SAMD1Q6SPF0 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SAMD1Q6SPF0 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SAMD1Q6SPF0 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SAMD1Q6SPF0 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SAMD1Q6SPF0 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SAMD1Q6SPF0 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SAMD1Q6SPF0 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SAMD1Q6SPF0 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SAMD1Q6SPF0 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SAMD1Q6SPF0 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SAMD1Q6SPF0 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SAMD1Q6SPF0 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SAMD1Q6SPF0 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SAMD1Q6SPF0 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SAMD1Q6SPF0 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SAMD1Q6SPF0 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SAMD1Q6SPF0 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SAMD1Q6SPF0 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SAMD1Q6SPF0 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SAMD1Q6SPF0 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SAMD1Q6SPF0 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SAMD1Q6SPF0 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SAMD1Q6SPF0 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SAMD1Q6SPF0 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SAMD1Q6SPF0 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SAMD1Q6SPF0 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SAMD1Q6SPF0 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SAMD1Q6SPF0 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SAMD1Q6SPF0 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SAMD1Q6SPF0 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SAMD1Q6SPF0 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SAMD1Q6SPF0 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SAMD1Q6SPF0 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SAMD1Q6SPF0 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SAMD1Q6SPF0 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SAMD1Q6SPF0 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SAMD1Q6SPF0 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SAMD1Q6SPF0 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SAMD1Q6SPF0 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SAMD1Q6SPF0 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SAMD1Q6SPF0 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SAMD1Q6SPF0 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SAMD1Q6SPF0 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SAMD1Q6SPF0 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SAMD1Q6SPF0 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SAMD1Q6SPF0 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SAMD1Q6SPF0 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SAMD1Q6SPF0 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SAMD1Q6SPF0 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SAMD1Q6SPF0 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SAMD1Q6SPF0 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SAMD1Q6SPF0 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SAMD1Q6SPF0 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SAMD1Q6SPF0 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SAMD1Q6SPF0 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SAMD1Q6SPF0 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SAMD1Q6SPF0 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SAMD1Q6SPF0 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SAMD1Q6SPF0 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SAMD1Q6SPF0 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SAMD1Q6SPF0 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SAMD1Q6SPF0 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SAMD1Q6SPF0 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SAMD1Q6SPF0 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SAMD1Q6SPF0 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SAMD1Q6SPF0 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SAMD1Q6SPF0 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SAMD1Q6SPF0 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SAMD1Q6SPF0 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SAMD1Q6SPF0 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SAMD1Q6SPF0 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
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