Protein–RNA interactions for Protein: Q16825

PTPN21, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 21, humanhuman

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Length 1,174 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN21Q16825 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
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