Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC3.83□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 TARID-205ENST00000607033 2960 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 NR5A2-201ENST00000236914 3115 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 CNOT10-206ENST00000454516 2760 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 BAZ2B-204ENST00000392783 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
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