Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TAF1CQ15572 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TAF1CQ15572 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TAF1CQ15572 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TAF1CQ15572 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TAF1CQ15572 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TAF1CQ15572 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TAF1CQ15572 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TAF1CQ15572 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TAF1CQ15572 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TAF1CQ15572 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TAF1CQ15572 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TAF1CQ15572 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
TAF1CQ15572 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TAF1CQ15572 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
TAF1CQ15572 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
TAF1CQ15572 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TAF1CQ15572 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TAF1CQ15572 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
TAF1CQ15572 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
TAF1CQ15572 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TAF1CQ15572 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TAF1CQ15572 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TAF1CQ15572 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TAF1CQ15572 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TAF1CQ15572 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TAF1CQ15572 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TAF1CQ15572 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TAF1CQ15572 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TAF1CQ15572 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TAF1CQ15572 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TAF1CQ15572 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TAF1CQ15572 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TAF1CQ15572 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TAF1CQ15572 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TAF1CQ15572 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TAF1CQ15572 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TAF1CQ15572 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
TAF1CQ15572 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
TAF1CQ15572 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TAF1CQ15572 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TAF1CQ15572 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TAF1CQ15572 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TAF1CQ15572 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TAF1CQ15572 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TAF1CQ15572 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TAF1CQ15572 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TAF1CQ15572 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TAF1CQ15572 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TAF1CQ15572 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TAF1CQ15572 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TAF1CQ15572 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TAF1CQ15572 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TAF1CQ15572 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TAF1CQ15572 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
TAF1CQ15572 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TAF1CQ15572 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TAF1CQ15572 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TAF1CQ15572 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
TAF1CQ15572 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
TAF1CQ15572 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
TAF1CQ15572 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TAF1CQ15572 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TAF1CQ15572 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TAF1CQ15572 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TAF1CQ15572 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TAF1CQ15572 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TAF1CQ15572 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TAF1CQ15572 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TAF1CQ15572 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TAF1CQ15572 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TAF1CQ15572 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TAF1CQ15572 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TAF1CQ15572 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TAF1CQ15572 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TAF1CQ15572 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TAF1CQ15572 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
TAF1CQ15572 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TAF1CQ15572 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TAF1CQ15572 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TAF1CQ15572 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TAF1CQ15572 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TAF1CQ15572 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TAF1CQ15572 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TAF1CQ15572 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TAF1CQ15572 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TAF1CQ15572 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TAF1CQ15572 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TAF1CQ15572 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TAF1CQ15572 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TAF1CQ15572 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TAF1CQ15572 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TAF1CQ15572 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
TAF1CQ15572 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TAF1CQ15572 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TAF1CQ15572 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TAF1CQ15572 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TAF1CQ15572 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TAF1CQ15572 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TAF1CQ15572 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.3 ms