Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NKX1-1Q15270 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NKX1-1Q15270 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NKX1-1Q15270 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NKX1-1Q15270 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NKX1-1Q15270 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
NKX1-1Q15270 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
NKX1-1Q15270 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NKX1-1Q15270 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NKX1-1Q15270 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NKX1-1Q15270 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NKX1-1Q15270 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NKX1-1Q15270 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NKX1-1Q15270 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NKX1-1Q15270 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NKX1-1Q15270 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NKX1-1Q15270 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NKX1-1Q15270 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NKX1-1Q15270 VGLL4-219ENST00000638314 93 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NKX1-1Q15270 AC018555.1-201ENST00000567548 1980 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NKX1-1Q15270 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
NKX1-1Q15270 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NKX1-1Q15270 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NKX1-1Q15270 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.61
NKX1-1Q15270 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NKX1-1Q15270 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NKX1-1Q15270 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NKX1-1Q15270 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NKX1-1Q15270 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NKX1-1Q15270 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NKX1-1Q15270 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NKX1-1Q15270 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NKX1-1Q15270 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NKX1-1Q15270 RPL31P61-201ENST00000496160 376 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NKX1-1Q15270 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NKX1-1Q15270 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NKX1-1Q15270 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NKX1-1Q15270 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
NKX1-1Q15270 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NKX1-1Q15270 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NKX1-1Q15270 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
NKX1-1Q15270 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NKX1-1Q15270 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NKX1-1Q15270 RN7SL585P-201ENST00000470538 280 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NKX1-1Q15270 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NKX1-1Q15270 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NKX1-1Q15270 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NKX1-1Q15270 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NKX1-1Q15270 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
NKX1-1Q15270 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
NKX1-1Q15270 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
NKX1-1Q15270 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
NKX1-1Q15270 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
NKX1-1Q15270 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NKX1-1Q15270 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
NKX1-1Q15270 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NKX1-1Q15270 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
NKX1-1Q15270 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NKX1-1Q15270 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NKX1-1Q15270 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NKX1-1Q15270 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
NKX1-1Q15270 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NKX1-1Q15270 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NKX1-1Q15270 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NKX1-1Q15270 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
NKX1-1Q15270 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NKX1-1Q15270 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NKX1-1Q15270 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NKX1-1Q15270 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NKX1-1Q15270 PHEX-201ENST00000379374 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NKX1-1Q15270 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NKX1-1Q15270 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NKX1-1Q15270 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NKX1-1Q15270 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NKX1-1Q15270 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NKX1-1Q15270 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NKX1-1Q15270 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NKX1-1Q15270 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NKX1-1Q15270 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NKX1-1Q15270 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NKX1-1Q15270 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NKX1-1Q15270 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NKX1-1Q15270 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NKX1-1Q15270 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NKX1-1Q15270 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
NKX1-1Q15270 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
NKX1-1Q15270 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
NKX1-1Q15270 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
NKX1-1Q15270 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
NKX1-1Q15270 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
NKX1-1Q15270 RPS26P28-201ENST00000470806 348 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
NKX1-1Q15270 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
NKX1-1Q15270 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
NKX1-1Q15270 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
NKX1-1Q15270 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
NKX1-1Q15270 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
NKX1-1Q15270 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
NKX1-1Q15270 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
NKX1-1Q15270 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
NKX1-1Q15270 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
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