Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
PCOLCEQ15113 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.8 ms