Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GBX1Q14549 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GBX1Q14549 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GBX1Q14549 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GBX1Q14549 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
GBX1Q14549 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
GBX1Q14549 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
GBX1Q14549 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GBX1Q14549 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
GBX1Q14549 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GBX1Q14549 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GBX1Q14549 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC2.62□□□□□ -1.99
GBX1Q14549 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GBX1Q14549 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
GBX1Q14549 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GBX1Q14549 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GBX1Q14549 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GBX1Q14549 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GBX1Q14549 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GBX1Q14549 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GBX1Q14549 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GBX1Q14549 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GBX1Q14549 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GBX1Q14549 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GBX1Q14549 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GBX1Q14549 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GBX1Q14549 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GBX1Q14549 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GBX1Q14549 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GBX1Q14549 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
GBX1Q14549 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GBX1Q14549 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GBX1Q14549 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
GBX1Q14549 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
GBX1Q14549 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GBX1Q14549 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
GBX1Q14549 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
GBX1Q14549 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
GBX1Q14549 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.61□□□□□ -1.99
GBX1Q14549 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
GBX1Q14549 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
GBX1Q14549 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
GBX1Q14549 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
GBX1Q14549 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
GBX1Q14549 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
GBX1Q14549 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
GBX1Q14549 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
GBX1Q14549 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
GBX1Q14549 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
GBX1Q14549 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
GBX1Q14549 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
GBX1Q14549 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
GBX1Q14549 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
GBX1Q14549 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
GBX1Q14549 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
GBX1Q14549 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
GBX1Q14549 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
GBX1Q14549 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
GBX1Q14549 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
GBX1Q14549 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
GBX1Q14549 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
GBX1Q14549 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
GBX1Q14549 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
GBX1Q14549 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
GBX1Q14549 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
GBX1Q14549 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
GBX1Q14549 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
GBX1Q14549 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GBX1Q14549 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GBX1Q14549 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GBX1Q14549 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GBX1Q14549 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GBX1Q14549 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GBX1Q14549 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
GBX1Q14549 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GBX1Q14549 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GBX1Q14549 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GBX1Q14549 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GBX1Q14549 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GBX1Q14549 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
GBX1Q14549 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GBX1Q14549 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GBX1Q14549 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GBX1Q14549 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GBX1Q14549 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GBX1Q14549 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GBX1Q14549 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GBX1Q14549 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GBX1Q14549 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GBX1Q14549 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GBX1Q14549 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GBX1Q14549 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GBX1Q14549 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GBX1Q14549 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GBX1Q14549 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GBX1Q14549 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
GBX1Q14549 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GBX1Q14549 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GBX1Q14549 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
GBX1Q14549 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.9 ms