Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
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