Protein–RNA interactions for Protein: Q13136

PPFIA1, Liprin-alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA1Q13136 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
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