Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TRAF3Q13114 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
TRAF3Q13114 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
TRAF3Q13114 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
TRAF3Q13114 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
TRAF3Q13114 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
TRAF3Q13114 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
TRAF3Q13114 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TRAF3Q13114 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TRAF3Q13114 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
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