Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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