Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 OR52N5-202ENST00000641181 2778 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.21
SENP3Q9H4L4 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SENP3Q9H4L4 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SENP3Q9H4L4 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SENP3Q9H4L4 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SENP3Q9H4L4 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SENP3Q9H4L4 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SENP3Q9H4L4 ZBTB21-205ENST00000398511 5608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SENP3Q9H4L4 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SENP3Q9H4L4 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SENP3Q9H4L4 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SENP3Q9H4L4 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SENP3Q9H4L4 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SENP3Q9H4L4 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SENP3Q9H4L4 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SENP3Q9H4L4 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SENP3Q9H4L4 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SENP3Q9H4L4 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SENP3Q9H4L4 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SENP3Q9H4L4 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SENP3Q9H4L4 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SENP3Q9H4L4 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SENP3Q9H4L4 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SENP3Q9H4L4 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SENP3Q9H4L4 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SENP3Q9H4L4 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SENP3Q9H4L4 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SENP3Q9H4L4 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SENP3Q9H4L4 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SENP3Q9H4L4 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SENP3Q9H4L4 DCC-203ENST00000442544 10206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SENP3Q9H4L4 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SENP3Q9H4L4 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SENP3Q9H4L4 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SENP3Q9H4L4 HIPK2-202ENST00000406875 15049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SENP3Q9H4L4 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SENP3Q9H4L4 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SENP3Q9H4L4 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SENP3Q9H4L4 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SENP3Q9H4L4 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SENP3Q9H4L4 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SENP3Q9H4L4 MCM10-201ENST00000378694 4587 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SENP3Q9H4L4 NAV1-201ENST00000367295 11645 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
SENP3Q9H4L4 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
SENP3Q9H4L4 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
SENP3Q9H4L4 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
SENP3Q9H4L4 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
SENP3Q9H4L4 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
SENP3Q9H4L4 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
SENP3Q9H4L4 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
SENP3Q9H4L4 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
SENP3Q9H4L4 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
SENP3Q9H4L4 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
SENP3Q9H4L4 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SENP3Q9H4L4 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SENP3Q9H4L4 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SENP3Q9H4L4 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
SENP3Q9H4L4 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SENP3Q9H4L4 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SENP3Q9H4L4 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SENP3Q9H4L4 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SENP3Q9H4L4 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SENP3Q9H4L4 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SENP3Q9H4L4 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SENP3Q9H4L4 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SENP3Q9H4L4 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SENP3Q9H4L4 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SENP3Q9H4L4 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SENP3Q9H4L4 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SENP3Q9H4L4 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SENP3Q9H4L4 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SENP3Q9H4L4 OR2AG1-202ENST00000641258 6993 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SENP3Q9H4L4 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SENP3Q9H4L4 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SENP3Q9H4L4 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SENP3Q9H4L4 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SENP3Q9H4L4 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SENP3Q9H4L4 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SENP3Q9H4L4 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SENP3Q9H4L4 BRWD3-201ENST00000373275 11381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SENP3Q9H4L4 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SENP3Q9H4L4 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
SENP3Q9H4L4 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
SENP3Q9H4L4 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
SENP3Q9H4L4 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
SENP3Q9H4L4 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
SENP3Q9H4L4 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SENP3Q9H4L4 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SENP3Q9H4L4 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SENP3Q9H4L4 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SENP3Q9H4L4 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SENP3Q9H4L4 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SENP3Q9H4L4 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SENP3Q9H4L4 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SENP3Q9H4L4 SNORA70H-201ENST00000383910 135 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SENP3Q9H4L4 SNORA70J-201ENST00000384182 135 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SENP3Q9H4L4 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SENP3Q9H4L4 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SENP3Q9H4L4 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SENP3Q9H4L4 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
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