Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.79□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC1.78□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.13
CHCHD4Q8N4Q1 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
CHCHD4Q8N4Q1 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC1.77□□□□□ -2.13
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CHCHD4Q8N4Q1 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.77□□□□□ -2.13
CHCHD4Q8N4Q1 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CHCHD4Q8N4Q1 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CHCHD4Q8N4Q1 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CHCHD4Q8N4Q1 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
CHCHD4Q8N4Q1 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CHCHD4Q8N4Q1 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CHCHD4Q8N4Q1 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
CHCHD4Q8N4Q1 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CHCHD4Q8N4Q1 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CHCHD4Q8N4Q1 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CHCHD4Q8N4Q1 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CHCHD4Q8N4Q1 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CHCHD4Q8N4Q1 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.77□□□□□ -2.13
CHCHD4Q8N4Q1 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CHCHD4Q8N4Q1 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CHCHD4Q8N4Q1 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CHCHD4Q8N4Q1 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CHCHD4Q8N4Q1 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CHCHD4Q8N4Q1 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CHCHD4Q8N4Q1 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CHCHD4Q8N4Q1 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CHCHD4Q8N4Q1 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CHCHD4Q8N4Q1 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
CHCHD4Q8N4Q1 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CHCHD4Q8N4Q1 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CHCHD4Q8N4Q1 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CHCHD4Q8N4Q1 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CHCHD4Q8N4Q1 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
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