Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC1.07□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
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ZBED9Q6R2W3 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
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