Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC4.21□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 TARID-205ENST00000607033 2960 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPRNQ16849 PHEX-201ENST00000379374 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPRNQ16849 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPRNQ16849 BTAF1-204ENST00000544642 6938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPRNQ16849 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPRNQ16849 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPRNQ16849 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPRNQ16849 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPRNQ16849 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPRNQ16849 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPRNQ16849 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPRNQ16849 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPRNQ16849 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPRNQ16849 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPRNQ16849 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPRNQ16849 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPRNQ16849 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPRNQ16849 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPRNQ16849 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
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PTPRNQ16849 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPRNQ16849 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPRNQ16849 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPRNQ16849 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
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PTPRNQ16849 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
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PTPRNQ16849 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
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PTPRNQ16849 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPRNQ16849 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPRNQ16849 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPRNQ16849 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPRNQ16849 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPRNQ16849 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPRNQ16849 OR9H1P-201ENST00000446393 4888 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPRNQ16849 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPRNQ16849 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPRNQ16849 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
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PTPRNQ16849 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPRNQ16849 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPRNQ16849 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPRNQ16849 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPRNQ16849 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPRNQ16849 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPRNQ16849 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPRNQ16849 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPRNQ16849 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPRNQ16849 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPRNQ16849 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPRNQ16849 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPRNQ16849 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPRNQ16849 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPRNQ16849 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPRNQ16849 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPRNQ16849 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPRNQ16849 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPRNQ16849 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPRNQ16849 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPRNQ16849 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPRNQ16849 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPRNQ16849 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPRNQ16849 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPRNQ16849 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
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