Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

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Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CKAP5Q14008 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CKAP5Q14008 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CKAP5Q14008 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CKAP5Q14008 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CKAP5Q14008 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CKAP5Q14008 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CKAP5Q14008 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CKAP5Q14008 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CKAP5Q14008 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
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CKAP5Q14008 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
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CKAP5Q14008 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
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CKAP5Q14008 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CKAP5Q14008 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
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