Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
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