Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
IKZF1Q13422 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
IKZF1Q13422 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
IKZF1Q13422 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
IKZF1Q13422 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
IKZF1Q13422 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
IKZF1Q13422 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
IKZF1Q13422 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
IKZF1Q13422 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
IKZF1Q13422 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
IKZF1Q13422 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
IKZF1Q13422 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
IKZF1Q13422 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
IKZF1Q13422 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
IKZF1Q13422 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
IKZF1Q13422 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
IKZF1Q13422 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
IKZF1Q13422 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
IKZF1Q13422 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
IKZF1Q13422 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
IKZF1Q13422 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
IKZF1Q13422 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
IKZF1Q13422 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
IKZF1Q13422 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
IKZF1Q13422 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
IKZF1Q13422 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
IKZF1Q13422 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
IKZF1Q13422 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
IKZF1Q13422 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
IKZF1Q13422 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
IKZF1Q13422 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
IKZF1Q13422 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
IKZF1Q13422 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
IKZF1Q13422 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
IKZF1Q13422 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
IKZF1Q13422 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
IKZF1Q13422 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
IKZF1Q13422 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
IKZF1Q13422 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
IKZF1Q13422 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
IKZF1Q13422 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
IKZF1Q13422 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
IKZF1Q13422 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
IKZF1Q13422 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
IKZF1Q13422 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
IKZF1Q13422 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
IKZF1Q13422 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
IKZF1Q13422 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
IKZF1Q13422 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
IKZF1Q13422 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
IKZF1Q13422 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
IKZF1Q13422 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
IKZF1Q13422 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
IKZF1Q13422 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
IKZF1Q13422 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
IKZF1Q13422 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
IKZF1Q13422 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
IKZF1Q13422 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
IKZF1Q13422 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
IKZF1Q13422 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
IKZF1Q13422 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
IKZF1Q13422 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
IKZF1Q13422 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
IKZF1Q13422 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
IKZF1Q13422 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
IKZF1Q13422 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
IKZF1Q13422 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
IKZF1Q13422 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
IKZF1Q13422 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
IKZF1Q13422 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
IKZF1Q13422 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
IKZF1Q13422 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
IKZF1Q13422 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
IKZF1Q13422 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
IKZF1Q13422 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
IKZF1Q13422 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
IKZF1Q13422 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
IKZF1Q13422 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
IKZF1Q13422 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
IKZF1Q13422 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
IKZF1Q13422 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
IKZF1Q13422 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
IKZF1Q13422 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
IKZF1Q13422 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
IKZF1Q13422 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
IKZF1Q13422 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
IKZF1Q13422 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
IKZF1Q13422 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
IKZF1Q13422 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
IKZF1Q13422 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
IKZF1Q13422 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
IKZF1Q13422 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
IKZF1Q13422 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
IKZF1Q13422 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
IKZF1Q13422 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
IKZF1Q13422 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
IKZF1Q13422 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
IKZF1Q13422 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
IKZF1Q13422 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
IKZF1Q13422 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.5 ms