Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

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Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
SEMA3FQ13275 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
SEMA3FQ13275 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SEMA3FQ13275 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
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