Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 LINC02294-201ENST00000549330 497 ntTSL 2 BASIC0.39□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 MIR5589-201ENST00000579442 60 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC0.39□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC0.39□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 AC013437.2-201ENST00000639587 677 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC0.38□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 RNU6-1000P-201ENST00000391066 106 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC0.38□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 EXOSC3P1-201ENST00000448649 500 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 AC091212.1-201ENST00000474798 395 ntTSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 MIR4802-201ENST00000581881 80 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 AC069431.2-201ENST00000604149 1099 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.38□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.38□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 SNORA40.4-201ENST00000390971 128 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC0.37□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.37□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC0.37□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC0.37□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 RNU4-68P-201ENST00000364314 141 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC0.36□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC0.36□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC0.36□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC0.36□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC0.36□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.6 ms