Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXA3O43365 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
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