Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXQ1Q9C009 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXQ1Q9C009 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXQ1Q9C009 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXQ1Q9C009 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXQ1Q9C009 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXQ1Q9C009 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXQ1Q9C009 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXQ1Q9C009 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXQ1Q9C009 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXQ1Q9C009 LINC02471-203ENST00000641941 4752 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXQ1Q9C009 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXQ1Q9C009 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXQ1Q9C009 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXQ1Q9C009 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXQ1Q9C009 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXQ1Q9C009 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXQ1Q9C009 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXQ1Q9C009 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXQ1Q9C009 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXQ1Q9C009 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXQ1Q9C009 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXQ1Q9C009 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXQ1Q9C009 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXQ1Q9C009 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXQ1Q9C009 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXQ1Q9C009 OR56A1-203ENST00000641900 8448 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXQ1Q9C009 SLC25A17-202ENST00000402844 2405 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXQ1Q9C009 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXQ1Q9C009 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXQ1Q9C009 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXQ1Q9C009 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXQ1Q9C009 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXQ1Q9C009 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXQ1Q9C009 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXQ1Q9C009 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXQ1Q9C009 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXQ1Q9C009 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXQ1Q9C009 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXQ1Q9C009 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXQ1Q9C009 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXQ1Q9C009 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXQ1Q9C009 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXQ1Q9C009 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXQ1Q9C009 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXQ1Q9C009 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
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FOXQ1Q9C009 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
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FOXQ1Q9C009 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
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FOXQ1Q9C009 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXQ1Q9C009 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXQ1Q9C009 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
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FOXQ1Q9C009 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
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FOXQ1Q9C009 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXQ1Q9C009 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXQ1Q9C009 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXQ1Q9C009 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
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FOXQ1Q9C009 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXQ1Q9C009 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXQ1Q9C009 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXQ1Q9C009 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXQ1Q9C009 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXQ1Q9C009 RNU4ATAC6P-201ENST00000516592 126 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXQ1Q9C009 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXQ1Q9C009 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXQ1Q9C009 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXQ1Q9C009 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXQ1Q9C009 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXQ1Q9C009 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXQ1Q9C009 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXQ1Q9C009 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXQ1Q9C009 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXQ1Q9C009 AC018555.1-201ENST00000567548 1980 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXQ1Q9C009 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
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