Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS5

OTOP3, Otopetrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP3Q7RTS5 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC3.38□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC3.35□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
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