Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CTXN3Q4LDR2 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CTXN3Q4LDR2 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CTXN3Q4LDR2 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CTXN3Q4LDR2 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CTXN3Q4LDR2 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CTXN3Q4LDR2 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CTXN3Q4LDR2 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CTXN3Q4LDR2 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CTXN3Q4LDR2 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CTXN3Q4LDR2 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CTXN3Q4LDR2 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CTXN3Q4LDR2 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CTXN3Q4LDR2 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CTXN3Q4LDR2 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CTXN3Q4LDR2 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CTXN3Q4LDR2 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CTXN3Q4LDR2 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CTXN3Q4LDR2 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CTXN3Q4LDR2 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CTXN3Q4LDR2 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CTXN3Q4LDR2 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CTXN3Q4LDR2 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CTXN3Q4LDR2 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CTXN3Q4LDR2 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CTXN3Q4LDR2 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CTXN3Q4LDR2 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CTXN3Q4LDR2 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CTXN3Q4LDR2 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CTXN3Q4LDR2 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CTXN3Q4LDR2 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CTXN3Q4LDR2 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
CTXN3Q4LDR2 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CTXN3Q4LDR2 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CTXN3Q4LDR2 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CTXN3Q4LDR2 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CTXN3Q4LDR2 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CTXN3Q4LDR2 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CTXN3Q4LDR2 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CTXN3Q4LDR2 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CTXN3Q4LDR2 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CTXN3Q4LDR2 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CTXN3Q4LDR2 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CTXN3Q4LDR2 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
CTXN3Q4LDR2 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CTXN3Q4LDR2 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CTXN3Q4LDR2 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.6 ms