Protein–RNA interactions for Protein: Q16512

PKN1, Serine/threonine-protein kinase N1, humanhuman

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1Q16512 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC3.76□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC3.75□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC3.74□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.3 ms