Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CSHL1Q14406 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CSHL1Q14406 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CSHL1Q14406 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CSHL1Q14406 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CSHL1Q14406 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CSHL1Q14406 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CSHL1Q14406 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CSHL1Q14406 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CSHL1Q14406 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CSHL1Q14406 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CSHL1Q14406 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CSHL1Q14406 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CSHL1Q14406 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CSHL1Q14406 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CSHL1Q14406 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CSHL1Q14406 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
CSHL1Q14406 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CSHL1Q14406 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CSHL1Q14406 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CSHL1Q14406 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CSHL1Q14406 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CSHL1Q14406 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CSHL1Q14406 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CSHL1Q14406 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CSHL1Q14406 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CSHL1Q14406 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
CSHL1Q14406 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CSHL1Q14406 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CSHL1Q14406 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CSHL1Q14406 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
CSHL1Q14406 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CSHL1Q14406 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CSHL1Q14406 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
CSHL1Q14406 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CSHL1Q14406 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CSHL1Q14406 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CSHL1Q14406 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CSHL1Q14406 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CSHL1Q14406 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CSHL1Q14406 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CSHL1Q14406 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CSHL1Q14406 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CSHL1Q14406 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CSHL1Q14406 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CSHL1Q14406 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CSHL1Q14406 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CSHL1Q14406 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CSHL1Q14406 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CSHL1Q14406 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CSHL1Q14406 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CSHL1Q14406 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
CSHL1Q14406 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
CSHL1Q14406 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CSHL1Q14406 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CSHL1Q14406 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CSHL1Q14406 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CSHL1Q14406 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CSHL1Q14406 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CSHL1Q14406 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CSHL1Q14406 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CSHL1Q14406 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CSHL1Q14406 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CSHL1Q14406 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CSHL1Q14406 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CSHL1Q14406 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CSHL1Q14406 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CSHL1Q14406 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
CSHL1Q14406 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CSHL1Q14406 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CSHL1Q14406 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CSHL1Q14406 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CSHL1Q14406 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CSHL1Q14406 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
CSHL1Q14406 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
CSHL1Q14406 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
CSHL1Q14406 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
CSHL1Q14406 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
CSHL1Q14406 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CSHL1Q14406 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CSHL1Q14406 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CSHL1Q14406 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CSHL1Q14406 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
CSHL1Q14406 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
CSHL1Q14406 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CSHL1Q14406 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CSHL1Q14406 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CSHL1Q14406 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CSHL1Q14406 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
CSHL1Q14406 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CSHL1Q14406 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CSHL1Q14406 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CSHL1Q14406 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CSHL1Q14406 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CSHL1Q14406 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CSHL1Q14406 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CSHL1Q14406 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CSHL1Q14406 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CSHL1Q14406 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CSHL1Q14406 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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