Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RESTQ13127 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RESTQ13127 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
RESTQ13127 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RESTQ13127 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RESTQ13127 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RESTQ13127 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
RESTQ13127 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
RESTQ13127 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RESTQ13127 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RESTQ13127 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
RESTQ13127 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RESTQ13127 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RESTQ13127 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RESTQ13127 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RESTQ13127 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RESTQ13127 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RESTQ13127 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RESTQ13127 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
RESTQ13127 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RESTQ13127 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RESTQ13127 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
RESTQ13127 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RESTQ13127 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RESTQ13127 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RESTQ13127 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RESTQ13127 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RESTQ13127 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RESTQ13127 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RESTQ13127 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RESTQ13127 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RESTQ13127 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RESTQ13127 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RESTQ13127 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RESTQ13127 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RESTQ13127 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RESTQ13127 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RESTQ13127 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RESTQ13127 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RESTQ13127 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RESTQ13127 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RESTQ13127 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RESTQ13127 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
RESTQ13127 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RESTQ13127 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RESTQ13127 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RESTQ13127 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RESTQ13127 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RESTQ13127 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RESTQ13127 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RESTQ13127 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RESTQ13127 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RESTQ13127 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RESTQ13127 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RESTQ13127 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RESTQ13127 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RESTQ13127 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RESTQ13127 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RESTQ13127 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RESTQ13127 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RESTQ13127 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RESTQ13127 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RESTQ13127 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RESTQ13127 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RESTQ13127 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RESTQ13127 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RESTQ13127 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RESTQ13127 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RESTQ13127 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RESTQ13127 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RESTQ13127 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RESTQ13127 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RESTQ13127 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RESTQ13127 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RESTQ13127 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RESTQ13127 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
RESTQ13127 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
RESTQ13127 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RESTQ13127 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RESTQ13127 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RESTQ13127 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RESTQ13127 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RESTQ13127 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RESTQ13127 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RESTQ13127 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RESTQ13127 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RESTQ13127 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RESTQ13127 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RESTQ13127 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RESTQ13127 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RESTQ13127 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RESTQ13127 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RESTQ13127 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RESTQ13127 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RESTQ13127 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RESTQ13127 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RESTQ13127 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RESTQ13127 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RESTQ13127 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RESTQ13127 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.1 ms