Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

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Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
BPTFQ12830 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
BPTFQ12830 LINC00446-202ENST00000438327 357 ntTSL 3 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
BPTFQ12830 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
BPTFQ12830 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
BPTFQ12830 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
BPTFQ12830 AC027338.1-201ENST00000514840 825 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
BPTFQ12830 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
BPTFQ12830 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
BPTFQ12830 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
BPTFQ12830 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
BPTFQ12830 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
BPTFQ12830 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
BPTFQ12830 GJE1-201ENST00000450456 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
BPTFQ12830 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
BPTFQ12830 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
BPTFQ12830 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
BPTFQ12830 AC090680.2-201ENST00000550279 742 ntTSL 3 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
BPTFQ12830 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
BPTFQ12830 HMGB1P51-201ENST00000605166 638 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
BPTFQ12830 AP005212.4-201ENST00000614206 710 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
BPTFQ12830 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
BPTFQ12830 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
BPTFQ12830 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
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BPTFQ12830 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
BPTFQ12830 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
BPTFQ12830 MIR4263-201ENST00000584745 83 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
BPTFQ12830 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
BPTFQ12830 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
BPTFQ12830 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
BPTFQ12830 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
BPTFQ12830 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
BPTFQ12830 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
BPTFQ12830 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
BPTFQ12830 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
BPTFQ12830 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
BPTFQ12830 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
BPTFQ12830 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
BPTFQ12830 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
BPTFQ12830 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC-0.57□□□□□ -2.5
BPTFQ12830 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
BPTFQ12830 Y_RNA.365-201ENST00000365537 102 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
BPTFQ12830 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
BPTFQ12830 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
BPTFQ12830 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC-0.57□□□□□ -2.5
BPTFQ12830 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC-0.57□□□□□ -2.5
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BPTFQ12830 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC-0.57□□□□□ -2.5
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BPTFQ12830 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
BPTFQ12830 AC127540.1-201ENST00000580311 689 ntTSL 5 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
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BPTFQ12830 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
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BPTFQ12830 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
BPTFQ12830 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
BPTFQ12830 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
BPTFQ12830 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
BPTFQ12830 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
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BPTFQ12830 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
BPTFQ12830 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
BPTFQ12830 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
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