Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 RBPJ-202ENST00000342320 5761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 CCAR1-201ENST00000265872 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 SNX13-213ENST00000611725 6817 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 NDST4-204ENST00000613194 3439 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 RANP2-201ENST00000456833 229 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 KRTAP5-14P-201ENST00000502328 121 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 IGHV1-14-201ENST00000523391 241 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 AC073916.1-201ENST00000545095 130 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 CR1-201ENST00000367049 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 SLC2A14-218ENST00000543909 4125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 SNORD8-201ENST00000363915 110 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 GNG5P2-201ENST00000372054 207 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
HOXD11P31277 RFX4-203ENST00000392842 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
HOXD11P31277 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
HOXD11P31277 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
HOXD11P31277 WDR35-201ENST00000281405 6918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
HOXD11P31277 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
HOXD11P31277 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
HOXD11P31277 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
HOXD11P31277 CNOT1-202ENST00000441024 4999 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
HOXD11P31277 MOB1B-201ENST00000309395 6963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
HOXD11P31277 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
HOXD11P31277 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
HOXD11P31277 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
HOXD11P31277 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
HOXD11P31277 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
HOXD11P31277 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
HOXD11P31277 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
HOXD11P31277 AL033380.1-201ENST00000442781 421 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
HOXD11P31277 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
HOXD11P31277 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
HOXD11P31277 FRK-201ENST00000606080 13230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
HOXD11P31277 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
HOXD11P31277 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
HOXD11P31277 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
HOXD11P31277 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
HOXD11P31277 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
HOXD11P31277 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
HOXD11P31277 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
HOXD11P31277 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
HOXD11P31277 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
HOXD11P31277 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
HOXD11P31277 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
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