Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SENP3Q9H4L4 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SENP3Q9H4L4 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SENP3Q9H4L4 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
SENP3Q9H4L4 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SENP3Q9H4L4 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SENP3Q9H4L4 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
SENP3Q9H4L4 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.2
SENP3Q9H4L4 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
SENP3Q9H4L4 GABRB2-201ENST00000274547 7409 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SENP3Q9H4L4 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SENP3Q9H4L4 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SENP3Q9H4L4 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SENP3Q9H4L4 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SENP3Q9H4L4 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SENP3Q9H4L4 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SENP3Q9H4L4 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SENP3Q9H4L4 AL033380.1-201ENST00000442781 421 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SENP3Q9H4L4 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SENP3Q9H4L4 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SENP3Q9H4L4 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SENP3Q9H4L4 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SENP3Q9H4L4 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SENP3Q9H4L4 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SENP3Q9H4L4 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SENP3Q9H4L4 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SENP3Q9H4L4 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SENP3Q9H4L4 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SENP3Q9H4L4 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SENP3Q9H4L4 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SENP3Q9H4L4 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SENP3Q9H4L4 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SENP3Q9H4L4 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SENP3Q9H4L4 CASP10-202ENST00000286186 5928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SENP3Q9H4L4 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SENP3Q9H4L4 TCEANC2-201ENST00000234827 10436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SENP3Q9H4L4 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SENP3Q9H4L4 RNU6-446P-201ENST00000362827 106 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SENP3Q9H4L4 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SENP3Q9H4L4 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SENP3Q9H4L4 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SENP3Q9H4L4 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SENP3Q9H4L4 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SENP3Q9H4L4 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SENP3Q9H4L4 TRPM6-202ENST00000360774 8425 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SENP3Q9H4L4 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SENP3Q9H4L4 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SENP3Q9H4L4 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SENP3Q9H4L4 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SENP3Q9H4L4 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SENP3Q9H4L4 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SENP3Q9H4L4 AC011504.1-201ENST00000623331 4103 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SENP3Q9H4L4 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SENP3Q9H4L4 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SENP3Q9H4L4 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SENP3Q9H4L4 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SENP3Q9H4L4 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SENP3Q9H4L4 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SENP3Q9H4L4 PEAK1-202ENST00000558305 4644 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SENP3Q9H4L4 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SENP3Q9H4L4 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SENP3Q9H4L4 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SENP3Q9H4L4 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SENP3Q9H4L4 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SENP3Q9H4L4 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SENP3Q9H4L4 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SENP3Q9H4L4 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SENP3Q9H4L4 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SENP3Q9H4L4 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SENP3Q9H4L4 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SENP3Q9H4L4 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SENP3Q9H4L4 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SENP3Q9H4L4 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SENP3Q9H4L4 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SENP3Q9H4L4 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SENP3Q9H4L4 RNU4ATAC6P-201ENST00000516592 126 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SENP3Q9H4L4 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SENP3Q9H4L4 TMED3-202ENST00000424155 16555 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SENP3Q9H4L4 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SENP3Q9H4L4 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SENP3Q9H4L4 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SENP3Q9H4L4 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
SENP3Q9H4L4 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
SENP3Q9H4L4 SLC30A6-201ENST00000282587 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
SENP3Q9H4L4 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
SENP3Q9H4L4 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SENP3Q9H4L4 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
SENP3Q9H4L4 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SENP3Q9H4L4 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SENP3Q9H4L4 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
SENP3Q9H4L4 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
SENP3Q9H4L4 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
SENP3Q9H4L4 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
SENP3Q9H4L4 KCNMB3P1-202ENST00000493696 3389 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
SENP3Q9H4L4 PLEKHA1-201ENST00000368988 3872 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SENP3Q9H4L4 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
SENP3Q9H4L4 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
SENP3Q9H4L4 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
SENP3Q9H4L4 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
SENP3Q9H4L4 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
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