Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.03□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
GEN1Q17RS7 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GEN1Q17RS7 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GEN1Q17RS7 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GEN1Q17RS7 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GEN1Q17RS7 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GEN1Q17RS7 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GEN1Q17RS7 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GEN1Q17RS7 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
GEN1Q17RS7 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GEN1Q17RS7 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GEN1Q17RS7 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GEN1Q17RS7 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
GEN1Q17RS7 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GEN1Q17RS7 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GEN1Q17RS7 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GEN1Q17RS7 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GEN1Q17RS7 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GEN1Q17RS7 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GEN1Q17RS7 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GEN1Q17RS7 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GEN1Q17RS7 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GEN1Q17RS7 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GEN1Q17RS7 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
GEN1Q17RS7 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
GEN1Q17RS7 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
GEN1Q17RS7 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GEN1Q17RS7 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GEN1Q17RS7 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GEN1Q17RS7 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
GEN1Q17RS7 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
GEN1Q17RS7 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
GEN1Q17RS7 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GEN1Q17RS7 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GEN1Q17RS7 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GEN1Q17RS7 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GEN1Q17RS7 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
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GEN1Q17RS7 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
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GEN1Q17RS7 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GEN1Q17RS7 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
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GEN1Q17RS7 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
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GEN1Q17RS7 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GEN1Q17RS7 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GEN1Q17RS7 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GEN1Q17RS7 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GEN1Q17RS7 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
GEN1Q17RS7 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
GEN1Q17RS7 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GEN1Q17RS7 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
GEN1Q17RS7 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
GEN1Q17RS7 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GEN1Q17RS7 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GEN1Q17RS7 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GEN1Q17RS7 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GEN1Q17RS7 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GEN1Q17RS7 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GEN1Q17RS7 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
GEN1Q17RS7 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
GEN1Q17RS7 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GEN1Q17RS7 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GEN1Q17RS7 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GEN1Q17RS7 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GEN1Q17RS7 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GEN1Q17RS7 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GEN1Q17RS7 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
GEN1Q17RS7 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GEN1Q17RS7 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GEN1Q17RS7 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GEN1Q17RS7 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GEN1Q17RS7 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
GEN1Q17RS7 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
GEN1Q17RS7 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
GEN1Q17RS7 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
GEN1Q17RS7 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC3□□□□□ -1.93
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