Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
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