Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB8

LONRF1, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF1Q17RB8 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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LONRF1Q17RB8 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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LONRF1Q17RB8 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
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LONRF1Q17RB8 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.97
LONRF1Q17RB8 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
LONRF1Q17RB8 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
LONRF1Q17RB8 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
LONRF1Q17RB8 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
LONRF1Q17RB8 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
LONRF1Q17RB8 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
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LONRF1Q17RB8 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
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LONRF1Q17RB8 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
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LONRF1Q17RB8 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
LONRF1Q17RB8 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
LONRF1Q17RB8 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
LONRF1Q17RB8 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
LONRF1Q17RB8 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
LONRF1Q17RB8 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
LONRF1Q17RB8 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
LONRF1Q17RB8 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
LONRF1Q17RB8 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
LONRF1Q17RB8 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
LONRF1Q17RB8 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
LONRF1Q17RB8 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
LONRF1Q17RB8 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
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