Protein–RNA interactions for Protein: Q16512

PKN1, Serine/threonine-protein kinase N1, humanhuman

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Length 942 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1Q16512 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
PKN1Q16512 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
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