Protein–RNA interactions for Protein: Q15436

SEC23A, Protein transport protein Sec23A, humanhuman

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Length 765 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23AQ15436 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SEC23AQ15436 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
SEC23AQ15436 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SEC23AQ15436 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
SEC23AQ15436 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SEC23AQ15436 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
SEC23AQ15436 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SEC23AQ15436 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SEC23AQ15436 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SEC23AQ15436 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SEC23AQ15436 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SEC23AQ15436 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SEC23AQ15436 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SEC23AQ15436 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SEC23AQ15436 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SEC23AQ15436 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SEC23AQ15436 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SEC23AQ15436 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SEC23AQ15436 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SEC23AQ15436 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
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SEC23AQ15436 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
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SEC23AQ15436 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
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SEC23AQ15436 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
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SEC23AQ15436 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
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SEC23AQ15436 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
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SEC23AQ15436 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
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SEC23AQ15436 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
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SEC23AQ15436 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
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SEC23AQ15436 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
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SEC23AQ15436 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
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SEC23AQ15436 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
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SEC23AQ15436 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
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