Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 MIR7702-201ENST00000621931 59 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 MIR432-201ENST00000606207 94 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 RNA5SP104-201ENST00000410989 118 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
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NKX1-1Q15270 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
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