Protein–RNA interactions for Protein: Q13591

SEMA5A, Semaphorin-5A, humanhuman

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA5AQ13591 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SEMA5AQ13591 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SEMA5AQ13591 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SEMA5AQ13591 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SEMA5AQ13591 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SEMA5AQ13591 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SEMA5AQ13591 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
SEMA5AQ13591 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
SEMA5AQ13591 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SEMA5AQ13591 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SEMA5AQ13591 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SEMA5AQ13591 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SEMA5AQ13591 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SEMA5AQ13591 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SEMA5AQ13591 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SEMA5AQ13591 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SEMA5AQ13591 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SEMA5AQ13591 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SEMA5AQ13591 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SEMA5AQ13591 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SEMA5AQ13591 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SEMA5AQ13591 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SEMA5AQ13591 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SEMA5AQ13591 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SEMA5AQ13591 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SEMA5AQ13591 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SEMA5AQ13591 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SEMA5AQ13591 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SEMA5AQ13591 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SEMA5AQ13591 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SEMA5AQ13591 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SEMA5AQ13591 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SEMA5AQ13591 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SEMA5AQ13591 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SEMA5AQ13591 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SEMA5AQ13591 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SEMA5AQ13591 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SEMA5AQ13591 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SEMA5AQ13591 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SEMA5AQ13591 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SEMA5AQ13591 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SEMA5AQ13591 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SEMA5AQ13591 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SEMA5AQ13591 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SEMA5AQ13591 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SEMA5AQ13591 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SEMA5AQ13591 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SEMA5AQ13591 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SEMA5AQ13591 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SEMA5AQ13591 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SEMA5AQ13591 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SEMA5AQ13591 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SEMA5AQ13591 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SEMA5AQ13591 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SEMA5AQ13591 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SEMA5AQ13591 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SEMA5AQ13591 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SEMA5AQ13591 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SEMA5AQ13591 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SEMA5AQ13591 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA5AQ13591 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA5AQ13591 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA5AQ13591 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA5AQ13591 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA5AQ13591 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA5AQ13591 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA5AQ13591 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA5AQ13591 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA5AQ13591 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA5AQ13591 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA5AQ13591 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA5AQ13591 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA5AQ13591 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA5AQ13591 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA5AQ13591 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA5AQ13591 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA5AQ13591 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA5AQ13591 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA5AQ13591 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA5AQ13591 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA5AQ13591 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA5AQ13591 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA5AQ13591 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA5AQ13591 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA5AQ13591 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA5AQ13591 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA5AQ13591 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA5AQ13591 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA5AQ13591 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA5AQ13591 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA5AQ13591 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA5AQ13591 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA5AQ13591 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA5AQ13591 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA5AQ13591 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA5AQ13591 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA5AQ13591 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA5AQ13591 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA5AQ13591 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA5AQ13591 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.5 ms