Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 AC025554.1-201ENST00000505641 188 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PKD2Q13563 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PKD2Q13563 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PKD2Q13563 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PKD2Q13563 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PKD2Q13563 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PKD2Q13563 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PKD2Q13563 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PKD2Q13563 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PKD2Q13563 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PKD2Q13563 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PKD2Q13563 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PKD2Q13563 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PKD2Q13563 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PKD2Q13563 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PKD2Q13563 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PKD2Q13563 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PKD2Q13563 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PKD2Q13563 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PKD2Q13563 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PKD2Q13563 GNRHR2P1-201ENST00000555315 631 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PKD2Q13563 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PKD2Q13563 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PKD2Q13563 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PKD2Q13563 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PKD2Q13563 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PKD2Q13563 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PKD2Q13563 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PKD2Q13563 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PKD2Q13563 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PKD2Q13563 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PKD2Q13563 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PKD2Q13563 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PKD2Q13563 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PKD2Q13563 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PKD2Q13563 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PKD2Q13563 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PKD2Q13563 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PKD2Q13563 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PKD2Q13563 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PKD2Q13563 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PKD2Q13563 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
PKD2Q13563 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
PKD2Q13563 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
PKD2Q13563 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PKD2Q13563 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PKD2Q13563 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PKD2Q13563 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PKD2Q13563 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PKD2Q13563 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PKD2Q13563 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PKD2Q13563 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PKD2Q13563 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PKD2Q13563 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PKD2Q13563 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PKD2Q13563 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PKD2Q13563 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PKD2Q13563 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PKD2Q13563 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PKD2Q13563 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PKD2Q13563 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PKD2Q13563 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PKD2Q13563 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PKD2Q13563 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PKD2Q13563 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PKD2Q13563 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PKD2Q13563 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PKD2Q13563 UNC13C-201ENST00000260323 12946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PKD2Q13563 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PKD2Q13563 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PKD2Q13563 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PKD2Q13563 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PKD2Q13563 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PKD2Q13563 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PKD2Q13563 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PKD2Q13563 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PKD2Q13563 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PKD2Q13563 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PKD2Q13563 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PKD2Q13563 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PKD2Q13563 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PKD2Q13563 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PKD2Q13563 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PKD2Q13563 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PKD2Q13563 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PKD2Q13563 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PKD2Q13563 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PKD2Q13563 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PKD2Q13563 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PKD2Q13563 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PKD2Q13563 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PKD2Q13563 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PKD2Q13563 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PKD2Q13563 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PKD2Q13563 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PKD2Q13563 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PKD2Q13563 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PKD2Q13563 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PKD2Q13563 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PKD2Q13563 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.1 ms