Protein–RNA interactions for Protein: Q13445

TMED1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED1Q13445 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TMED1Q13445 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TMED1Q13445 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TMED1Q13445 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TMED1Q13445 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TMED1Q13445 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TMED1Q13445 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.56□□□□□ -2.32
TMED1Q13445 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.56□□□□□ -2.32
TMED1Q13445 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.56□□□□□ -2.32
TMED1Q13445 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TMED1Q13445 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TMED1Q13445 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TMED1Q13445 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TMED1Q13445 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TMED1Q13445 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TMED1Q13445 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC0.56□□□□□ -2.32
TMED1Q13445 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TMED1Q13445 USP9YP25-201ENST00000457708 443 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TMED1Q13445 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TMED1Q13445 MTND2P31-201ENST00000512602 616 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TMED1Q13445 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TMED1Q13445 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TMED1Q13445 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TMED1Q13445 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TMED1Q13445 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TMED1Q13445 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TMED1Q13445 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TMED1Q13445 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TMED1Q13445 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC0.55□□□□□ -2.32
TMED1Q13445 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TMED1Q13445 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TMED1Q13445 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TMED1Q13445 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TMED1Q13445 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TMED1Q13445 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TMED1Q13445 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TMED1Q13445 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TMED1Q13445 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TMED1Q13445 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TMED1Q13445 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TMED1Q13445 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TMED1Q13445 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TMED1Q13445 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC0.54□□□□□ -2.32
TMED1Q13445 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TMED1Q13445 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TMED1Q13445 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
TMED1Q13445 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
TMED1Q13445 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TMED1Q13445 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TMED1Q13445 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
TMED1Q13445 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TMED1Q13445 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TMED1Q13445 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
TMED1Q13445 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TMED1Q13445 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.54□□□□□ -2.32
TMED1Q13445 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.53□□□□□ -2.32
TMED1Q13445 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TMED1Q13445 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TMED1Q13445 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TMED1Q13445 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
TMED1Q13445 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TMED1Q13445 EXOSC3P1-201ENST00000448649 500 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TMED1Q13445 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TMED1Q13445 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TMED1Q13445 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
TMED1Q13445 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TMED1Q13445 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TMED1Q13445 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TMED1Q13445 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TMED1Q13445 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TMED1Q13445 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TMED1Q13445 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.53□□□□□ -2.32
TMED1Q13445 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TMED1Q13445 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TMED1Q13445 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TMED1Q13445 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TMED1Q13445 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TMED1Q13445 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TMED1Q13445 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TMED1Q13445 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TMED1Q13445 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
TMED1Q13445 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
TMED1Q13445 AC069431.2-201ENST00000604149 1099 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TMED1Q13445 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TMED1Q13445 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TMED1Q13445 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TMED1Q13445 AL049777.1-201ENST00000622740 518 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TMED1Q13445 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TMED1Q13445 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TMED1Q13445 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TMED1Q13445 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TMED1Q13445 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TMED1Q13445 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TMED1Q13445 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TMED1Q13445 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC0.51□□□□□ -2.33
TMED1Q13445 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TMED1Q13445 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TMED1Q13445 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TMED1Q13445 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TMED1Q13445 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 165.4 ms