Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
TRAF3Q13114 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TRAF3Q13114 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
TRAF3Q13114 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TRAF3Q13114 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TRAF3Q13114 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
TRAF3Q13114 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
TRAF3Q13114 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
TRAF3Q13114 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.01
TRAF3Q13114 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.01
TRAF3Q13114 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
TRAF3Q13114 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TRAF3Q13114 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TRAF3Q13114 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TRAF3Q13114 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TRAF3Q13114 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TRAF3Q13114 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TRAF3Q13114 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TRAF3Q13114 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TRAF3Q13114 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TRAF3Q13114 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TRAF3Q13114 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TRAF3Q13114 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TRAF3Q13114 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TRAF3Q13114 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
TRAF3Q13114 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TRAF3Q13114 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TRAF3Q13114 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
TRAF3Q13114 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TRAF3Q13114 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TRAF3Q13114 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TRAF3Q13114 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TRAF3Q13114 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TRAF3Q13114 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TRAF3Q13114 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TRAF3Q13114 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
TRAF3Q13114 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TRAF3Q13114 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
TRAF3Q13114 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
TRAF3Q13114 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
TRAF3Q13114 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
TRAF3Q13114 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TRAF3Q13114 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TRAF3Q13114 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TRAF3Q13114 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TRAF3Q13114 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TRAF3Q13114 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TRAF3Q13114 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TRAF3Q13114 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TRAF3Q13114 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
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TRAF3Q13114 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TRAF3Q13114 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
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TRAF3Q13114 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TRAF3Q13114 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TRAF3Q13114 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TRAF3Q13114 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
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TRAF3Q13114 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
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TRAF3Q13114 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
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TRAF3Q13114 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
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TRAF3Q13114 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TRAF3Q13114 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TRAF3Q13114 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TRAF3Q13114 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
TRAF3Q13114 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
TRAF3Q13114 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
TRAF3Q13114 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
TRAF3Q13114 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
TRAF3Q13114 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
TRAF3Q13114 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
TRAF3Q13114 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TRAF3Q13114 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TRAF3Q13114 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TRAF3Q13114 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TRAF3Q13114 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TRAF3Q13114 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
TRAF3Q13114 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TRAF3Q13114 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TRAF3Q13114 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TRAF3Q13114 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TRAF3Q13114 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
TRAF3Q13114 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
TRAF3Q13114 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TRAF3Q13114 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TRAF3Q13114 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TRAF3Q13114 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
TRAF3Q13114 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TRAF3Q13114 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TRAF3Q13114 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TRAF3Q13114 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
TRAF3Q13114 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
TRAF3Q13114 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TRAF3Q13114 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TRAF3Q13114 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
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