Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 AC016588.2-201ENST00000632484 3021 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 RNU6-788P-201ENST00000390967 104 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 AL162151.2-201ENST00000448875 158 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
MKRN3Q13064 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
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