Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
TRDNQ13061 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
TRDNQ13061 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TRDNQ13061 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TRDNQ13061 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TRDNQ13061 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
TRDNQ13061 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
TRDNQ13061 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
TRDNQ13061 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TRDNQ13061 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TRDNQ13061 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TRDNQ13061 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
TRDNQ13061 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TRDNQ13061 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
TRDNQ13061 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TRDNQ13061 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
TRDNQ13061 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
TRDNQ13061 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
TRDNQ13061 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
TRDNQ13061 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
TRDNQ13061 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
TRDNQ13061 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TRDNQ13061 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TRDNQ13061 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TRDNQ13061 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TRDNQ13061 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TRDNQ13061 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
TRDNQ13061 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TRDNQ13061 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TRDNQ13061 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TRDNQ13061 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TRDNQ13061 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TRDNQ13061 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TRDNQ13061 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
TRDNQ13061 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TRDNQ13061 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
TRDNQ13061 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
TRDNQ13061 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TRDNQ13061 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TRDNQ13061 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TRDNQ13061 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
TRDNQ13061 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
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TRDNQ13061 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TRDNQ13061 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
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TRDNQ13061 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
TRDNQ13061 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
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TRDNQ13061 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
TRDNQ13061 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TRDNQ13061 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
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TRDNQ13061 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TRDNQ13061 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TRDNQ13061 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TRDNQ13061 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
TRDNQ13061 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TRDNQ13061 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TRDNQ13061 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TRDNQ13061 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TRDNQ13061 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TRDNQ13061 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
TRDNQ13061 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TRDNQ13061 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
TRDNQ13061 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
TRDNQ13061 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TRDNQ13061 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TRDNQ13061 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TRDNQ13061 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TRDNQ13061 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TRDNQ13061 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TRDNQ13061 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TRDNQ13061 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TRDNQ13061 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TRDNQ13061 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
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