Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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