Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
STX4Q12846 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
STX4Q12846 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
STX4Q12846 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
STX4Q12846 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
STX4Q12846 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
STX4Q12846 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
STX4Q12846 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
STX4Q12846 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
STX4Q12846 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
STX4Q12846 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
STX4Q12846 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
STX4Q12846 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
STX4Q12846 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
STX4Q12846 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
STX4Q12846 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
STX4Q12846 CLPTM1LP1-201ENST00000604519 484 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
STX4Q12846 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
STX4Q12846 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
STX4Q12846 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
STX4Q12846 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
STX4Q12846 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
STX4Q12846 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
STX4Q12846 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
STX4Q12846 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
STX4Q12846 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
STX4Q12846 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
STX4Q12846 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
STX4Q12846 MTND2P39-201ENST00000457230 764 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
STX4Q12846 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
STX4Q12846 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
STX4Q12846 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
STX4Q12846 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
STX4Q12846 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
STX4Q12846 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
STX4Q12846 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
STX4Q12846 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
STX4Q12846 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
STX4Q12846 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
STX4Q12846 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
STX4Q12846 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
STX4Q12846 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
STX4Q12846 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
STX4Q12846 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.87□□□□□ -2.27
STX4Q12846 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
STX4Q12846 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
STX4Q12846 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
STX4Q12846 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
STX4Q12846 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
STX4Q12846 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
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STX4Q12846 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
STX4Q12846 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
STX4Q12846 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
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STX4Q12846 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
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STX4Q12846 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
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STX4Q12846 MTND2P32-201ENST00000521584 1038 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
STX4Q12846 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
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STX4Q12846 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
STX4Q12846 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
STX4Q12846 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
STX4Q12846 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
STX4Q12846 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
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STX4Q12846 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
STX4Q12846 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
STX4Q12846 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC0.85□□□□□ -2.27
STX4Q12846 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
STX4Q12846 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
STX4Q12846 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
STX4Q12846 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
STX4Q12846 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
STX4Q12846 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
STX4Q12846 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
STX4Q12846 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
STX4Q12846 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
STX4Q12846 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
STX4Q12846 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
STX4Q12846 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
STX4Q12846 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.27
STX4Q12846 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
STX4Q12846 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
STX4Q12846 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
STX4Q12846 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
STX4Q12846 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC0.84□□□□□ -2.27
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