Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CTIFO43310 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CTIFO43310 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CTIFO43310 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CTIFO43310 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CTIFO43310 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CTIFO43310 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CTIFO43310 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CTIFO43310 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CTIFO43310 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CTIFO43310 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CTIFO43310 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CTIFO43310 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CTIFO43310 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CTIFO43310 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
CTIFO43310 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CTIFO43310 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CTIFO43310 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CTIFO43310 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CTIFO43310 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CTIFO43310 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CTIFO43310 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CTIFO43310 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CTIFO43310 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CTIFO43310 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CTIFO43310 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CTIFO43310 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CTIFO43310 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CTIFO43310 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CTIFO43310 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CTIFO43310 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CTIFO43310 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CTIFO43310 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CTIFO43310 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CTIFO43310 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CTIFO43310 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CTIFO43310 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CTIFO43310 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CTIFO43310 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CTIFO43310 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CTIFO43310 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CTIFO43310 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CTIFO43310 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CTIFO43310 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
CTIFO43310 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CTIFO43310 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CTIFO43310 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CTIFO43310 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CTIFO43310 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CTIFO43310 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CTIFO43310 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CTIFO43310 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CTIFO43310 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CTIFO43310 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
CTIFO43310 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CTIFO43310 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
CTIFO43310 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CTIFO43310 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CTIFO43310 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CTIFO43310 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CTIFO43310 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CTIFO43310 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CTIFO43310 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CTIFO43310 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CTIFO43310 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CTIFO43310 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CTIFO43310 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CTIFO43310 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CTIFO43310 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CTIFO43310 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CTIFO43310 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CTIFO43310 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CTIFO43310 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CTIFO43310 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CTIFO43310 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CTIFO43310 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CTIFO43310 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CTIFO43310 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CTIFO43310 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CTIFO43310 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CTIFO43310 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CTIFO43310 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CTIFO43310 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CTIFO43310 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
CTIFO43310 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CTIFO43310 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CTIFO43310 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CTIFO43310 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CTIFO43310 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CTIFO43310 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CTIFO43310 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CTIFO43310 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CTIFO43310 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CTIFO43310 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CTIFO43310 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CTIFO43310 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CTIFO43310 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CTIFO43310 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CTIFO43310 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CTIFO43310 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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