Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
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PTPRNQ16849 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPRNQ16849 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
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PTPRNQ16849 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
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PTPRNQ16849 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPRNQ16849 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPRNQ16849 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPRNQ16849 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPRNQ16849 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPRNQ16849 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
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