Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC4□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC4□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC4□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC4□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC4□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC4□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC4□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC4□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC4□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC4□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC4□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC4□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC4□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC4□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC4□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC4□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
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HIF1AQ16665 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
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HIF1AQ16665 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
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HIF1AQ16665 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
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HIF1AQ16665 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
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HIF1AQ16665 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 RPL23AP48-201ENST00000406913 488 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 AC112715.1-201ENST00000445534 350 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
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